II型內(nèi)含子(group II introns)

主要存在于線粒體中的一類(lèi)內(nèi)含子，它的剪接位點(diǎn)類(lèi)似于核編碼結(jié)構(gòu)基因的內(nèi)含子,并同樣遵從GT--AG規(guī)律。剪接機(jī)理同核內(nèi)含子的剪接相似,也要形成一個(gè)套索的中間體,通過(guò)形成5＇-2＇磷酸二酯鍵將要剪接的位點(diǎn)靠近到一起。但是,II型內(nèi)含子的剪接又不完全與核內(nèi)含子的剪接相同,它具有自我剪接的功能,不需要剪接體和snRNA的參與,也不需要ATP供能。從結(jié)構(gòu)上看,II型內(nèi)含子的6個(gè)結(jié)構(gòu)域可形成發(fā)夾環(huán), 結(jié)構(gòu)域5與6之間只間隔3個(gè)堿基,結(jié)構(gòu)域6參與轉(zhuǎn)酯作用。