MLST
多位點序列分型（multilocus sequence typing, MLST）是一種基于核酸序列測定的常規細菌分型方法。該方法由多位點酶電泳（multilocus enzyme electroiphoresis, MLEE）方法發展而來，通過直接測定細菌表達代謝相關酶的管家基因（House-keeping gene）的核苷酸序列，分析細菌進化和群體生物學特征，從而進行分型。
MLST一般測定6-10個管家基因內部400-600bp片段的核苷酸序列，每個位點的序列根據其發現的時間順序賦予一個等位基因編號，每一株菌的等位基因編號按照指定的順序排列就是其等位基因譜，即是這株菌的ST（sequence type）。這樣得到的每一個ST均代表一組單獨的核苷酸序列信息，通過比較ST可以發現菌株的相關性。
MLST分析方法：針對管家基因設計引物對其進行PCR擴增和測序，得出每個菌株各個位點的等位基因數值，然后進行等位基因圖譜（allelic profile）或序列類型（sequence types, STs）鑒定，再根據等位基因圖譜使用配對差異矩陣（matrix pair-wise differences）等方法構建系統樹圖進行聚類分析。實際運用中，對于已有的成熟MLST方案的細菌，可直接從MLST數據庫中獲取分型方案。
MLST可以準確地記錄細菌基因水平上的變異，并且核酸序列容易獲取，所以該方法不僅被用于研究細菌的流行病學、群體生物學、致病性和進化，而且還可以用來追溯耐藥菌株的來源和傳播。
