黃素蛋白是由一條多肽結合1個輔基組成的酶類,結合的輔基可以是FAD或FMN,它們是維生素B2的衍生物,每個輔基能夠接受和提供兩個質子和電子。線粒體中的黃素蛋白主要是電子傳遞鏈中NADH脫氫酶和TCA循環中的琥珀酸脫氫酶。
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