DNA(基因)檢測-Southern Blot
DNA 吸印轉(zhuǎn)移
1. 室溫下將電泳后的瓊脂糖凝膠浸入 500ml 溶液 A 中,搖動 30 分鐘后換 500ml 新鮮溶液 A 再搖 30 分鐘,使 DNA 雙鏈堿變性。
溶液 A :
5M NaCl 300.0ml
10M NaOH 50.0ml
H2 O 650.0ml
2 .為使凝膠重新回到中性,換入溶液 B 中重復(fù)上述 1 過程。
溶液 B :
10M 乙酸銨 200.0ml
10M NaOH 4.0ml
H2 O 1796.1ml
硝酸纖維素薄膜( NC 膜)
3 .料盒或盤中放一玻璃板支架,倒入 10 × SSC ,將 Whatman 3MM 濾紙放在玻璃板上,兩頭浸在液體中,用玻棒趕除氣泡。
4. 心地將瓊脂糖凝膠翻過(扣過來)滑到紙上,放平、趕除氣泡。
5. 將預(yù)先浸于溶液 B 中的 NC 膜,平鋪在膠上,用玻棒趕除氣泡。
6. 在膜上放置兩層預(yù)先以 10 × SSC 浸濕的 Whatman 3MM 濾紙。
7. 再放 6 張干燥吸水紙及 4 堆 3cm 厚的折疊吸水紙。
8. 在紙上覆蓋玻璃平板,板上可置約 250g 重物,下部緩沖液根據(jù)虹吸原理能被吸上來,凝膠上的單鏈 DNA 即可被吸出并轉(zhuǎn)移到 NC 膜上。轉(zhuǎn)移速度取決于 DNA 片段的大小。 <1kb 的片段在 0.7 %的膠中 2 小時即可轉(zhuǎn)出,而 15kb 的片段需 15 小時以上,一般維持 12 ~ 24 小時。
9. 轉(zhuǎn)移完成后,將膠與膜取出,通過樣品槽、表明記號,并剪去膜的一角,以識別方向,此時膜與膠正面觀察的方向是一致的。
10. 去掉膠,令膜稍加干燥,用圓珠筆標(biāo)號。
11. 如為硝酸纖維素膜,則用 3MM 濾膜包好, 80 ℃烘烤 2 小時。若為尼龍膜則用紫外等照 10 分鐘,使 DNA 牢固地結(jié)合于膜上,即可用于分子雜交。
12. 將膜在 6 × SSC 中浸泡幾分鐘,放入塑料袋,按 0.2ml/cm2 膜面積加入預(yù)雜交液,排凈氣泡封閉袋口,在 68 ℃水浴中振動預(yù)雜交 2 ~ 4 小時。
13. 取出塑料袋,在一角切一缺口,倒出預(yù)雜交液,按 50 μ l/cm2 膜面積加入雜交液,排凈氣泡、封口,再于 68 ℃水浴中振動雜交,一般來源于真核細(xì)胞的總 DNA ,需雜交 12 ~ 16 小時。
14. 雜交結(jié)束后取出塑料袋,剪開邊緣,迅速將膜轉(zhuǎn)到 2 × SSC 和 0.5 % EDTA 溶液中室溫下洗滌(振蕩) 5 分鐘,再將膜轉(zhuǎn)移人 2 × SSC 和 0.1 % SDS 溶液中洗滌 15min ,然后將膜浸入 0.1 倍 SSC 和 0.5 % SDS 溶液中 68 ℃振蕩洗滌 2 小時,換同樣溶液再洗滌 30 分鐘。
15. 取出濾膜在 Whatman 濾紙上晾干,放入塑料袋或用塑料紙包好,在暗室中將 X 光片與濾膜接觸,封于曝光夾中,進(jìn)行放射自顯影 1 ~ 15 天。
16. X 光片被取出。常規(guī)顯定影后顯示雜交情況,如曝光時間不夠可重新放入 X 光片再次曝光,直到帶型顯示清晰。