RNA 的制備與分析
RNA:主要由四種核糖核苷酸組成,即腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)。天然的RNA并不象DNA那樣呈雙螺旋結構,而是單鏈線形分子。只有局部區域為雙螺旋結構(約占RNA分子的50%)。RNA分子中的核苷酸至少75個,多的可達數千個。
RNA的分類:(1)信使RNA(mRNA)(2)轉移RNA(tRNA)(3)核糖體RNA(rRNA)(4)小RNA(snRNA)
常用的RNA分析方法:(1)RT-PCR(Reverse Transcription PCR)(反) 逆轉錄聚合酶鏈反應(2)原位雜交(In situ hybridization)(3)Northern Blot(4)RNA斑點和狹線雜交(5)S1核酸酶作圖法(6)引物延伸法。
一、RNA的提取與純化:
(一)控制RNA酶的活性:
1、控制污染:
(1)專用的RNA操作室、專用器械。
(2)操作時戴口罩、帽子、手套。
(3)實驗用器皿、吸頭、離心管應為新的。
(4)所配制的水溶液,盡可能用DEPC處理。
2、已污染RNA酶的器具的處理
(1)在180℃的高溫下干烤8小時或更長時間。
(2)氯仿沖洗。
(3)雙氧水浸泡。
(4)0.1%DEPC(焦碳酸二乙酯)水浸泡。
3、常用的RNA抑制劑:
(1)焦磷酸二乙酯(DEPC):一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑,通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環反應從而抑制酶的活性。
(2)異硫氰酸胍:最有效的RNA酶抑制劑。在裂解組織細胞的同時,也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結構使核酸從核蛋白中分離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。
(3)氧釩糖核苷復合物:由氧化釩離子和核苷形成的復合物,與RNA酶結合后幾乎能完全抑制RNA酶的活性。
(4)RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從人胎盤中分離出來,可以和多種RNA酶結合,使其失活。
(5)其它:SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定的抑制作用。