微量RNA的抽提RNeasy MinElute Spin Column(QIAGEN)
抽提微量RNA的柱子最大可以吸附45ug 的RNA。
·為了更好地裂解,細(xì)胞數(shù)不能大于5×105,細(xì)胞過多會減低產(chǎn)率和純度。
準(zhǔn)備工作:
1.在 24 ml 96-100%乙醇 中加入 6 ml 去RNA酶的水。
2.在每 1 ml Buffer RLT 中加入10 ml β-ME (加入β-ME的Buffer RLT可在室溫下放置1月)。
3. Buffer RPE中加入4倍體積的96-100%乙醇。
4.在 550 ml 的去RNA酶的水中加入1500 Kunitz單位的DNA酶1,輕輕翻轉(zhuǎn)試管混勻,勿振蕩(溶好的DNA酶1分裝后,-20℃可放置9個月,2-8℃可放置6周)
5.當(dāng)細(xì)胞數(shù)少于5000個,須在勻漿前在溶液中加入載體 RNA。
首次用時,在1ml 去RNA酶的水中加入 310 ug 載體RNA,則載體RNA的濃度為310 ug/ul,置-20℃保存。
實(shí)驗(yàn)時所需濃度為4ng/ul,配制如下:取5 ul 濃度為310 ug/ul的載體RNA,加入34 ul Buffer RLT,吹打混勻,再取 6 ul 稀釋液加入54 ul Buffer RLT,得終濃度4 ng/ ul,加5ul到第3步的溶液中。
微量RNA的抽提
步驟:
1.收集細(xì)胞:300×g離心5 min( 離心管 自備),沉淀細(xì)胞,仔細(xì)吸去上清液。
2.加入Buffer RLT分散細(xì)胞。輕敲 試管 將沉淀弄分散,加入350 ul Buffer RLT振蕩或吹打混勻,
·當(dāng)細(xì)胞少于1×10 5 ,Buffer RLT可用75ul (可用小管),振蕩1 min 混勻,接第4步。
3.勻漿細(xì)胞:
細(xì)胞數(shù)少于5000個時,加20 ng 載體RNA ( 4ng/ul 溶液 5 ul),到溶解液中。
3a 在柱子中加入溶解液,置于2ml收集管中,以最大速度離心2min;
4.加入1倍體積的(約350 ul)70%乙醇 到勻漿的液體中,吹打混勻(勿離心),
·若勻漿的液體有所丟失,相應(yīng)地減少70%乙醇的量,
·若第2步中用了75ul的Buffer RLT,則只用75 ul 70%乙醇。
5.將樣本(包括可能形成的沉淀)加入到柱子中(柱子放在一個2ml的收集管中),輕輕蓋上管蓋, 8000×g ( or 10000rpm)離心15s,棄掉過濾到收集管中的液體。收集管繼續(xù)用
6.加入350 ul的Buffer RW1 到柱子中,輕輕蓋上管蓋,8000×g(or 10000rpm)離心15s洗柱子,棄掉收集管中的液體,接第8步。
7.在70 ul Buffer RDD中加入 10 ul DNase 1溶液,輕輕翻轉(zhuǎn) 試管 混勻。(勿振蕩)
8.吸起上述 80ul 混合液加入柱子中的硅膠薄膜上,室溫放置15min。(勿加到管壁上)
9 吸350ul Buffer RW1 到柱子中, 8000×g(or 10000rpm)離心15s,棄掉收集管及收集管中的液體。
10.將柱子轉(zhuǎn)到1個新的2ml 收集管中,加500 ul Buffer RPE 到柱子中,輕輕蓋上 試管 8000×g(or 10000rpm)離心15s洗柱子,棄掉收集管中的液體,收集管再用。
11.加500 ul 80%乙醇 到柱子中,輕輕蓋上管蓋,8000×g(or 10000rpm)離心2 min 以使硅膠薄膜干燥,棄掉收集管及收集管中的液體。(柱子不要碰到收集管中的液體)
12.將柱子轉(zhuǎn)入1個新的2ml 管中,打開蓋子,以最大速度離心5min,棄掉收集管和管中的液體。
13.將柱子轉(zhuǎn)入1個新的1.5ml 的EP管中,加14 ul 去RNA酶的水到硅膠薄膜上,輕輕蓋上蓋子,以最大速度離心1min,將所得RNA溶液做逆轉(zhuǎn)錄或保存。