肝中RNA的分離與鑒定
原理
細(xì)胞內(nèi)的核酸多以核蛋白的形式存在,其中脫氧核糖核蛋白主要存在于細(xì)胞核中,核糖核蛋白主要存在于細(xì)胞質(zhì)中。這兩類核蛋白在0.14mol/L氯化鈉溶液中的溶解度相差很大。核糖核蛋白在此溶液中具有很高的溶解度、脫氧核糖核蛋白的溶解度卻相當(dāng)?shù)汀?/span>
制成肝勻漿后,用0.14mol/L氯化鈉溶液抽提,可將兩種核蛋白分離。分離過程中加入少量檸檬酸鈉,可抑制脫氧核糖核酸酶對DNA的水解作用。
在含有核糖核蛋白的0.14mol/L氯化鈉溶液中,調(diào)節(jié)pH至4.2,使其達(dá)到等點(diǎn)電,核糖核蛋白即從溶液中沉淀出;用熱的10%氯化鈉溶液抽提核糖核酸,最后用冷乙醇將核糖核酸鈉析出,而獲得純化的RNA。
DNA和RNA在波長260nm處有很高的吸收峰值,蛋白質(zhì)則在280nm處有很高的吸收峰值。利用這個原理,我們測定純化樣品在260nm和280nm處的吸光度,可以推算出樣品中RNA的濃度,并判斷其純度。
用標(biāo)準(zhǔn)樣品測得在波長260nm處,1μg/ml RNA鈉鹽吸光度為0.025,(光程為1cm),即A260=1時,樣品中RNA濃度為40 μg/ml。純凈的RNA樣品A260/A280的比值約為2.0,樣品中含有蛋白質(zhì)或其它雜質(zhì),會使A260/A280的比值下降。A260/A280的比值大于1.8基本能達(dá)到各種后繼實驗的要求。
操作
1.肝勻漿制備:新鮮兔肝,用0.9%NaCl洗去血液,除去結(jié)締組織,剪碎,稱取4g肝組織,加4m1 0.14mol/L NaCl溶液,勻漿器中研磨,制成肝勻漿。
2.分離核蛋白:肝勻漿倒入試管中,4000rpm離心5min,上清倒入另一試管中為A管。沉淀加2m1 0.14mol/L NaCl攪勻后再置勻漿器中研磨,4000rpm離心5min,上清倒入A管,沉淀重復(fù)上述操作,上清并入A管,沉淀棄去。
3.A管用10%乙酸調(diào)pH至4.2,混勻,靜置5min,4000rpm離心5min,傾去上清,沉淀含核糖核蛋白。
4.A管沉淀中加3m1 10%NaCl,攪勻,100℃水浴10min(不斷攪拌,防沸溢出),冷卻, 4000rpm離心5min,留上清液。
5.A管上清液加95%冷乙醇5ml,見乳白色核糖核酸鈉沉淀,混勻放置10min,4000rpm離心15min,沉淀為純化RNA。
6.RNA的溶解:沉淀中加入0.1 mol/L NaOH 4.0ml,攪拌溶解,2000rpm離心10min,上清液則為RNA水解液。
7.RNA的測定:用0.1mol/L NaOH 將樣品稀釋到一定濃度,以0.1mol/L NaOH 調(diào)零,測定樣品的A260和A280,計算出每克肝組織中的RNA含量,并判斷純化RNA的純度。
注意事項
1. 在制備肝勻漿時,應(yīng)盡量在冰冷條件下進(jìn)行。
2. 各步驟操作應(yīng)力求準(zhǔn)確,盡量減少中途核酸的丟失,保證定量測定的準(zhǔn)確性。
3. 稀釋后應(yīng)該盡量使樣品A260和A280處于0.1-0.7的范圍內(nèi)。
儀器
玻璃勻漿器
離心機(jī)
UV9100紫外可見分光光度計
試管
刻度吸管
試劑
1. 0.9%氯化鈉溶液。
2. 10%氯化鈉溶液。
3. 0.14mol/L氯化鈉溶液(含0.01 mol/L檸檬酸鈉):稱取氯化鈉 8.182g和檸檬酸鈉-2H2O 2.941g,用蒸餾水溶解并稀釋至1000m1。
4. 10%乙酸溶液。
5. 95%乙醇溶液(冷藏)
6. 0.1mol/L NaOH