單細(xì)胞miRNA表達(dá)譜
miRNA 是一類22 堿基左右的非編碼RNA,能夠被整合到沉默復(fù)合體(RISC)中,使堿基互補(bǔ)的目標(biāo)mRNA 沉默或降解,以實(shí)現(xiàn)其調(diào)控作用,與生物正常的生長(zhǎng)發(fā)育以及各種疾病如癌癥和心血管疾病等的發(fā)生都有著密切的關(guān)系。
單細(xì)胞miRNA表達(dá)解決方案
啟因生物獨(dú)家引進(jìn)美國(guó)NanoString公司的多基因表達(dá)計(jì)數(shù)系統(tǒng)nCounter assay system,它僅需100 ng的RNA
即可對(duì)逾八百個(gè)特異的mRNA轉(zhuǎn)錄子進(jìn)行準(zhǔn)確的定量;它無需酶促和擴(kuò)增過程,其檢測(cè)的敏感性和準(zhǔn)確性與實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT—PCR)技術(shù)相當(dāng)。檢測(cè)系統(tǒng)包括樣品制備工作站和數(shù)據(jù)分析儀,流程包括雜交、純化固定、計(jì)數(shù)三個(gè)步驟。
檢測(cè)特點(diǎn):
精度和準(zhǔn)確度:無需擴(kuò)增,靈敏性和特異性高,并且準(zhǔn)確識(shí)別度高,可以準(zhǔn)確區(qū)分高度相似的miRNA;
轉(zhuǎn)錄覆蓋面全面:全面的代碼集可供人類、小鼠、大鼠和果蠅等的miRNA轉(zhuǎn)錄,并且每24小時(shí)可快速提供96個(gè)樣品的上千萬數(shù)據(jù);
兼容性強(qiáng):總RNA,石蠟包埋組織總RNA;
可定制:標(biāo)準(zhǔn)-miRBase 覆蓋版設(shè)置,條形碼設(shè)置;
樣本來源:除了可對(duì)多種來源組織細(xì)胞提純的核酸進(jìn)行定量,還可對(duì)新鮮或凍存組織、細(xì)胞、細(xì)菌等的裂解物以及多聚甲醛固定石蠟包埋(formalin—fixed paraffin.embedded,F(xiàn)FPE)組織細(xì)胞的裂解物等直接進(jìn)行定量檢測(cè)。
nCounter技術(shù)能夠高通量的檢測(cè)800 多種人和人-病毒miRNA、600 余種小鼠miRNA 和400 余種大鼠 miRNA 以及184種果蠅miRNA,并進(jìn)行圖譜分析,而其靈敏度和特異性更與qPCR 相當(dāng);
檢測(cè)原理:一段特殊的橋接寡核苷酸(bridge oligo)分別特異的結(jié)合目標(biāo)miRNA 和其對(duì)應(yīng)的miRtag,并使兩者共價(jià)連接,經(jīng)過變性,miRNA:miRtag 復(fù)合物成為一條單鏈,這個(gè)復(fù)合物能夠和特定的捕獲探針、報(bào)告探針結(jié)合,并像普通的mRNA 一樣被定量檢測(cè)。
miRNA表達(dá)譜高水平的敏感性、特異性、精度和線性度等使其廣泛應(yīng)用在腫瘤、神經(jīng)生物學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、干細(xì)胞等領(lǐng)域的研究。