Genome Medicine: 提高癌癥治療效果的新方法

通過挖掘大量的遺傳數(shù)據(jù)，弗吉尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員有望促進醫(yī)生治療癌癥，預(yù)測患者預(yù)后并確定哪種治療方法最適合某類患者的能力。

研究人員已經(jīng)確定了我們基因的遺傳變異，這些變異影響患者在診斷后和治療過程中的表現(xiàn)。有了這些信息，醫(yī)生將能夠檢查患者的基因組成，從而提供真正個性化的藥物。

“腫瘤學(xué)家可以根據(jù)腫瘤的等級，分期，患者的年齡，腫瘤的類型等來估計患者的表現(xiàn)。我們發(fā)現(xiàn)[添加單個遺傳預(yù)測因子]可以將我們的預(yù)測能力提高5％達到10％”，UVA的MBBS博士Anindya Dutta說道。 “許多癌癥具有可預(yù)測結(jié)果的多種遺傳遺傳變化，因此，如果我們添加這些遺傳變化，而不是增加10％，我們可能會準(zhǔn)確預(yù)測患者如何使用當(dāng)前療法的能力增加30％ 。”

UVA的生物化學(xué)和分子遺傳學(xué)系主任Dutta認(rèn)為，回顧患者的遺傳遺傳組成可以為預(yù)測結(jié)果和選擇從糖尿病到心臟疾病的許多其他疾病提供類似的益處。因此，該方法代表了醫(yī)生努力根據(jù)患者的需求和基因組成量身定制治療方法的重要一步。

為什么有些病人的病情比其他病人好？這項研究為長期困擾醫(yī)生的問題提供了答案。Dutta說：“每位臨床醫(yī)生都有這樣的經(jīng)驗：兩名患者完全相同的癌癥-相同的等級，相同的階段，接受了相同的治療。其中一名患者表現(xiàn)很好，而另一名則沒有。” “一直以來，我們一直以為我們不了解這兩者之間的某些關(guān)聯(lián)，例如，可能有一個患者有某些腫瘤特異性突變，而另一位患者沒有。但是在我們看來，有了所有這些基因組數(shù)據(jù)，我們可以檢驗另一個假設(shè)。”

為了確定患者的遺傳差異是否是答案，Dutta和他的同事深入研究了“癌癥基因組圖集”，這是由美國國立衛(wèi)生研究院國家癌癥研究所收集的大量遺傳信息庫。研究人員試圖將遺傳遺傳變異與患者預(yù)后相關(guān)聯(lián)。

Dutta回憶說：“實驗室中一位非常聰明的博士生Ajay Chatrath在UVA的云計算服務(wù)的幫助下，設(shè)法下載了所有這些基因組測序數(shù)據(jù)，并確定了所謂的種系變異-不僅是腫瘤特異性突變，而且是從父母那里繼承并存在于所有細(xì)胞中的突變病人。”

研究人員開始時規(guī)模很小，但很快就意識到這項工作可以完成得很快，并且可以帶來多大的收益。Dutta說：“一旦我們意識到這是一件非常容易的事，我們就繼續(xù)進行了所有33種癌癥和所有10,000名患者的治療，這又花了六個月的時間。

Dutta渴望分享他的發(fā)現(xiàn)，希望找到合作者，并激發(fā)研究人員和私營企業(yè)開始為其他條件挖掘數(shù)據(jù)。他說：“這是非常容易實現(xiàn)的結(jié)果，不僅可以應(yīng)用于癌癥，而且可以應(yīng)用于所有類型的疾病，并且它們可以預(yù)測對所有類型療法的反應(yīng)性。”