宏基因組測序
宏基因組測序(metagenomic sequencing)
環(huán)境微生物是自然界中分布最廣、種類最多且數(shù)量最大的生物類群,挖掘并利用環(huán)境微生物新資源是目前環(huán)境微生物研究的重要內容之一。目前,人們對于環(huán)境中微生物研究主要建立在純培養(yǎng)基礎上,然而后者往往周期相對長,工作量相對大。近年來,高通量測序技術迅速發(fā)展,宏基因組學技術能夠避開傳統(tǒng)的微生物分離培養(yǎng)方法,以環(huán)境樣品中全部DNA為研究對象,直接從環(huán)境樣品中提取總DNA,構建文庫并上機測序,通過生物信息學分析獲取樣品中的微生物的組成、豐度和代謝通路等信息。宏基因組測序分析能夠明確樣品中的微生物種類與相對豐度,解析差異代謝通路,有助于探究微生物之間、微生物與環(huán)境及宿主之間的關系。宏基因組分析目前已廣泛應用于食品、化妝品、飼料、家電、臨床等領域,為傳統(tǒng)發(fā)酵食品中微生物結構分析、益生菌產(chǎn)品組成解析、污染菌溯源、腸道微生態(tài)研究等提供解決方案。


