擴(kuò)增子測(cè)序分析
擴(kuò)增子測(cè)序分析以環(huán)境樣品微生物群體基因組為研究對(duì)象,利用通用引物擴(kuò)增微生物基因組中的一段保守區(qū)域(如細(xì)菌的16S rDNA基因V3或V4區(qū)、真菌的ITS rDNA序列等),將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序,下機(jī)數(shù)據(jù)質(zhì)控后與特定數(shù)據(jù)庫比對(duì)來獲得物種分類信息,從而獲得樣品的物種種類、菌群結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)發(fā)育和遺傳多樣性等信息。擴(kuò)增子測(cè)序分析建立在高通量測(cè)序的基礎(chǔ)之上,與傳統(tǒng)的克隆文庫菌群分析相比,具有準(zhǔn)確、全面等優(yōu)點(diǎn),相較宏基因組測(cè)序分析,更快速、成本低,為復(fù)雜環(huán)境樣品中微生物組成及相對(duì)豐度分析提供了分析方法。