種子蛋白質(zhì)系統(tǒng)分析:種子蛋白質(zhì)亞基分析(SDS
一、目的
蛋白質(zhì)分子有單鏈、雙鏈和寡聚蛋白等組成形式,組成蛋白質(zhì)分子的單條肽鏈又稱亞基。通過對(duì)天然蛋白的聚丙烯酰胺凝膠電泳和變性蛋白的SDS 一聚丙烯酰胺凝膠電泳圖譜 的比較,可以研究種子蛋白質(zhì)分子組成和結(jié)構(gòu)。另外,SDS 一聚丙烯酰胺凝膠電泳是測(cè)定亞基分子質(zhì)量的好方法。通過本實(shí)驗(yàn),學(xué)習(xí)SDS 一聚丙烯酰胺凝膠電泳的原理、技術(shù)和實(shí)際應(yīng)用。
二、原理
用十二烷基硫酸鈉(SDS)和還原劑(琉基乙醇或二硫蘇糖醇)熱處理蛋白質(zhì)樣品,蛋白質(zhì)分子中的二硫鍵被還原,解離的亞基與SDS 發(fā)生1 : 1.4 的定量結(jié)合。SDS 使蛋白質(zhì)亞基帶上大量負(fù)電荷,掩蓋了蛋白質(zhì)各種亞基間原有的電荷差異。亞基的構(gòu)象均呈長(zhǎng)橢圓棒狀,各種蛋白質(zhì)亞基-SDS 復(fù)合物表現(xiàn)出相等的電荷密度。在電場(chǎng)中其遷移速率僅與亞基分子質(zhì)量有關(guān),因此,SDS-聚丙烯酞胺凝膠電泳 可以進(jìn)行蛋白質(zhì)亞基分離,并用來測(cè)量蛋白質(zhì)亞基的分子質(zhì)量。
三、儀器、試劑和材料
1.儀器
( 1)穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀
( 2)垂直板電泳槽
( 3)微量注射器
( 4)燒杯50ml X2
( 5)白瓷盤
( 6)脫色搖床
( 7)吸管0.5ml X 2 , 5mlx2 , 10mlx3
( 8)真空泵
( 9)臺(tái)式高速離心機(jī)
2.試劑
( 1 ) 2%瓊脂2g 瓊脂加電極緩沖液100 ml,水浴中溶化。
( 2)電極緩沖液Tris 6g , Gly28.8g , SDS 2g ,去離子水溶解后,用Hcl 調(diào)pH 值至8.3,水定容至2000ml 。
( 3 ) 30 % Aer Acr 30g,水溶后定容至100ml,過濾,冰箱中貯存?zhèn)溆谩?br style="box-sizing: border-box;"/>( 4 ) 1 % Bis Bis 1g ,水溶后定容至100ml,過濾,冰箱中貯存。
( 5)分離膠緩沖液(1.5mol / L Tris , pH8.7 ) Ths 15.17g,適量水溶解,然后用lmol
/ L HCI 調(diào)pH 值至8.7,定容至100ml 。
( 6)濃縮膠緩沖液(0.5mol / L Tris-Hcl , pH6.8 ) Tris 6.06g ,適量水溶解,然后用 lmol / L HCI 調(diào)pH 值至6.8,定容至l00ml。
( 7 ) 10 % SDS SDS 1g,加水10ml 溶解。
( 8 ) 10%過硫酸銨1g 過硫酸銨,加水10ml 溶解,現(xiàn)用現(xiàn)配,冰箱中最多可貯存一周。
( 9 ) TEMED(四甲基乙二胺)4℃,棕色瓶中貯存。
( 10)樣品緩沖液(pH8.0 ) Tris 6.05g,甘油50ml,巰基乙醇25ml,溴酚藍(lán)0.5g ,SDS l0g,溶于水,用HCI 調(diào)PH 至8.0,定容至500ml。
( 11)脫色液 甲醇:乙酸:水=5 : 1 : 5(體積比)
( 12)染色液(0.25%考馬斯亮藍(lán)R250)1.00g 考馬斯亮藍(lán)R250,用脫色液400ml溶解,過濾備用。
( 13)低分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液,包括溶菌酶(MW = 14 400Da)大豆胰蛋白酶抑制劑(21 5000)、碳酸酐酶(310000)、卵白蛋白(450000)、牛血清白蛋白 (66 2000)、磷酸化酶B (92 5000)。用樣品緩沖液配成2mg / ml 溶液,在沸水浴中加熱3-4min,冷卻后使用。
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