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中國(guó)微生物菌種

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原位聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(in situ PCR)和原位反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(in situ RT-PCR)操作規(guī)程
發(fā)布日期:2023-05-27 07:19:27


原位聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(in situ PCR)和原位反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(in situ RT-PCR)操作規(guī)程


(一)、儀器設(shè)備
英國(guó) Thermo Hybaid 原位 PCR 儀。
(二)、操作流程
1 、原位 PCR 步驟
1 )預(yù)處理:
 1 )切片常規(guī)脫蠟;
 2  0.2mol/L HCl 處理 10min 
 3  5 μ g/ml 蛋白酶 K 消化組織 37  10min 
 4  Nase 消化組織 37  30min 
 5 )梯度酒精脫水,室溫干燥。
2 )原位擴(kuò)增:
 1 )切片滴加特異性序列引物 30 μ LPCR 擴(kuò)增反應(yīng)液,覆蓋硅化蓋玻片,石蠟油封邊;
 2  PCR 熱循環(huán): 94 ℃, 1min  55 ℃, 1min  72 ℃, 1.5min ,共 25  30 個(gè)循環(huán), 72 ℃延伸 10min 
 3 )氯仿洗去蓋玻片, 4 %多聚甲醛后固定 10min ,梯度酒精脫水,干燥。
3) 原位雜交:
 1 )加地高辛標(biāo)記探針的雜交液, 98 ℃變性 10min  -20 ℃退火 5min  42 ℃雜交過(guò)夜。
 2 )雜交后用 2×SSC 洗滌 10min  3 次, 1×SSC 洗滌 10min  3 次;
 3 )緩沖液洗滌 10min  3 次;
 4 )加堿性磷酸酶標(biāo)記的羊抗地高辛抗體復(fù)合物, 37 ℃, 2h 
 5 )緩沖液洗滌 5min  3 次;
 6  NBT  BCIP 暗處顯色,鏡下控制,終止顯色。
 7 )常規(guī)脫水:透明、封固。
2 、原位 RT-PCR 步驟
1 )預(yù)處理:
 1 )蛋白酶 K(0.3mg/mL) 54 ℃消化 20min ,蒸餾水洗;
 2  95 ℃加熱 3min ,滅活殘存的蛋白酶。
2 )原位擴(kuò)增:
 1 )在有 RNA 酶抑制劑存在的條件下,用隨機(jī)六聚物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng);
 2 )用熱啟動(dòng)法進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。標(biāo)本加熱至 75 ℃時(shí)加上反應(yīng)液,覆以蓋玻片,四周用指甲油密封。然后將溫度升至 95 ℃, 2min 。再將熱循環(huán)儀設(shè)定為 95 ℃, 45s  55 ℃, 1min  75 ℃, 45s ,共 26 次循環(huán);
 3 )擴(kuò)增結(jié)束后,在 80 ℃烤 15min  30min 
3 )原位雜交:
 1 )雜交前標(biāo)本 95 ℃加熱 3min 
 2 )加上雜交液,濕盒內(nèi) 50 ℃過(guò)夜; 雜交液組成: 25 %硫酸葡聚糖, 2×SSC  50 %甲酰胺, 0.33mg/ml 變性的鮭魚(yú)精子 DNA   0  5mL 雜交液內(nèi)含生物素標(biāo)記探針 1ng 
 3 )擴(kuò)增的β - 肌動(dòng)蛋白和 IL-6  DAKO 檢測(cè)試劑盒 K600( 鏈霉卵白素,生物素標(biāo)記的堿性磷酸酶和硝基四氮唑藍(lán) ) 檢測(cè)。陽(yáng)性反應(yīng)呈紫色。

 


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