RIP技術（RNA結合蛋白免疫沉淀）

RIP技術（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA結合蛋白免疫沉淀），是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具，能幫助我們發現miRNA的調節靶點。

RIP這種新興的技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，然后經過分離純化就可以對結合在復合物上的RNA進行分析。RIP可以看成是普遍使用的染色質免疫沉淀ChIP技術的類似應用，但由于研究對象是RNA-蛋白復合物而不是DNA-蛋白復合物，RIP實驗的優化條件與ChIP實驗不太相同（如復合物不需要固定，RIP反應體系中的試劑和抗體絕對不能含有RNA酶，抗體需經RIP實驗驗證等等）。RIP技術下游結合microarray技術被稱為RIP-Chip，幫助我們更高通量地了解癌癥以及其它疾病整體水平的RNA變化。

RIP 實驗基本原理：

1. 用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白。

2. 防止非特異性的RNA的結合。

3. 免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來。

4.結合的RNA序列通過microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR或高通量測序（RIP-Seq）方法來鑒定。

延伸閱讀：95%的人類基因組并不編碼基因，而是產生大量的非編碼RNA,真正編碼蛋白質的基因只占人類總基因組的約2%。這些非編碼RNA在生命的生長發育的各個階段都發揮著重要的調節作用，與艾滋病、白血病、糖尿病、畸形等多種病變密切相關，并且參與著干細胞和表觀遺傳學調控。

而RNA-蛋白復合物驅動了幾乎所有細胞過程的基因表達的轉錄后調控，包括剪接（splicing）、出核轉運（nuclear export）、mRNA 穩定性以及蛋白轉譯過程，因此，對基因調控的了解就有賴于確定這些過程中RNA的結合的變化。因此，RNA研究也被越來越多的科學家重視起來，目前已經成為生命科學研究中一個炙手可熱的領域，而RIP技術也逐漸成為RNA研究領域的一項常規方法，幫助我們了解越來越受關注的轉錄后調控網絡。