RNA提取新手必讀
1. 使用正確的細胞或組織儲存條件
在樣品用液氮瞬間凍結之后,應該儲存在-80℃,千萬不能解凍。即使是置于含有胍鹽的裂解液中作勻漿前的短暫解凍,也會導致RNA的降解和損失。瞬間凍結的組織應該首先在超低溫條件下先研磨成粉,然后置于裂解液中進行勻漿。
RNAfixer使樣品儲存更為便利。儲存在RNAfixer中的細胞或組織可在室溫下穩定保存長達1個星期,在4℃可穩定保存長達1個月,或永久保存在-20℃。
2. 消除環境RNase的污染
為了得到完整的、高品質RNA,在整個RNA制備過程中,當RNA離開強蛋白變性劑(如離液裂解液或酚)的保護時,避免引入新的RNase污染就非常關鍵。由于RNase幾乎是無所不在,所以必須確保與純化的RNA接觸的每一樣東西都是無RNase污染的。所有的表面,包括移液器、工作臺、玻璃器皿和制膠設備,都必須用表面去污凈化溶液如RNase噴霧清除劑 來處理過,去除各種溶液或者反應緩沖液中可能存在的RNase污染,可以用RNAsafe.必須保證一直使用無RNase的槍頭、試管和溶液,手套也應經常更換。
3.迅速滅活內源的RNA酶,以防止RNA降解
以下3個方法均可有效使內源RNA酶失活:
1)用含離液(如胍鹽)的細胞裂解液收獲樣品,并立即勻漿。
2)用液氮瞬間凍結樣品。值得特別注意的是:組織塊必須保證足夠小,在浸入液氮的瞬間就能凍結,以確保瞬間令RNA酶失活。
3)立即將樣品置于RNAfixer無液氮RNA樣品儲存液中。它是一種水相、無毒的收集試劑,能立即穩定并保護完整、未凍結的組織和細胞樣品中的RNA.關鍵要點是組織樣品切片一定要夠薄(<0.5 cm),這樣RNAfixer才能在RNase破壞RNA之前迅速滲入組織塊中。
4. 選擇合適破壁方法
細胞或組織的徹底勻漿對RNA提取來說,是一個很關鍵的步驟,它能夠防止RNA的損失和降解。勻漿的方法應根據細胞或組織的類型來選擇。大部分培養的細胞可以置于細胞裂解液中,通過簡單的渦旋震蕩來勻漿;而動物組織、植物組織、酵母和細菌、真菌則常常需要更加劇烈的方法,通常用液氮研磨。比如說細菌(特別是革蘭氏陽性菌)的細胞壁,就需要溶菌酶消化來實現徹底的細胞裂解和RNA的最大回收,酵母提取時加入破壁酶幫助破壁,再用TRIpure或RNApure進行提取。