Trizol 法提取RNA實驗步驟
需要的試劑:
氯仿
異丙醇
75%乙醇(in DEPC-treated water)
RNase free水或者0.5% SDS溶液 [準備不含RNase的水,將其裝入不含RNase的玻璃瓶中,加入diethylpyrocarbonate (DEPC) to 0.01% (v/v)。靜置過夜,然后高壓滅菌。0.5% SDS溶液必須用DEPC預處理、高壓滅菌的水]
1、組織勻漿
(1) 取出高溫高壓消毒后研缽,切取50-100mg冰凍組織置于研缽內,倒入液氮,研碎。
(2) 每50-100mg均漿組織標本中加入1ml的TRIZOL,標本的量不能超過TRIZOL體積的10%,否則會出現DNA污染。
(3) 將以上勻漿標本轉移到1.5ml的EP管中,在15- 30°C放置5分鐘,以徹底分離核蛋白復合體。
2、相分離
加入0.2 ml的氯仿,加蓋好后用手劇烈搖晃15秒,在15- 30°C放置2-3分鐘,然后離心 12,000× g,15 minutes , 2 - 8°C。離心后分成三層,下面的紅色為酚-氯仿相,一個中間層,一面是無色的水相。RNA只存在于水相中。水相占總TRIZOL的60%。
3、RNA沉淀
將上層水相轉移到另一干凈的EP管中, 加入0.5ml異丙醇,混勻,靜置10 minutes ,15 -30°C,然后離心12,000 × g ,10 minutes, 2 - 8°C。離心前可以在管的側壁和底部看到絮狀膠樣沉淀,這就是RNA沉淀。
4、RNA洗滌
去上清, 加入1ml 75%乙醇洗滌RNA沉淀,振蕩器混勻,離心7,500 × g ,5 minutes,2 -8°C。
5、RNA再溶解
去上清,置真空或空氣中5-10分鐘,干燥RNA沉淀,(不能在真空中離心干燥)。注意不能將RNA沉淀完全干燥,這樣會極大地降低它的溶解度。部份溶解的RNA樣品其A260/280 ratio < 1.6。
用無RNase 水或0.5% SDS溶液重懸RNA沉淀,用槍頭反復吹打幾次,靜置10分鐘,55-60°C。測濃度后-20°C保存。
6、測濃度
取2μl 儲存液加入另一個EP管中,再加入98μl無RNase水,離心混勻,以無RNase水作空白對照,測OD260/280值。1 OD=40μg RNA。OD260/280值在1.8-2.0視為純度很高。一般濃在1000ng/ml較準。濃度太高要稀釋以后再測定。
7、RNA鑒定
甲醛變性瓊脂糖電泳,確定抽提RNA完整性和DNA污染情況。
注意事項:
在使用TRIZOL的時候要帶手套和眼罩,避免接觸到皮膚和衣服,使用化學通風櫥,防止蒸汽吸入。
除非特別說明,所有的操作均在15-30°C下進行,所用的試劑均放置于15-30°C。
組織在加入氯仿之前是可以在-60—-70°C放置一個月 。RNA沉淀在75%乙醇中在2-8°C下至少可以放置一周,在–5— -20°C至少可能放置一年。