cDNA合成技術
Promega公司的RibocloneR M-MLV(H- ) cDNA合成系統采用M-MLV反轉錄酶的RNase H缺失突變株取代AMV反轉錄酶,使合成的cDNA更長。該系統的第一鏈合成使用M-MLV反轉錄酶,cDNA第二鏈合成采用置換合成法,采用RNaseH和DNA聚合酶Ⅰ進行置換合成,最后用T4 DNA聚合酶切去單鏈末端,方法簡便易行。該系統試劑包括:
20μg 特異性引物
200μl M-MLV第一鏈緩沖液(5×),配方如下: 250mmol/L Tris·Cl pH8.3(37℃時); 375mmol/l KCl; 15mmol/L MgCl2; 50mmol/L DTT; 10mmol/L dATP, dCTP, dGTP, dTTP混合物(各2.5mmol/L)
2×625μ rRNasinR RNA酶抑制劑
10,000μ M-MLV反轉錄酶, RNase H-
5μg 對照RNA
400μl M-MLV第二鏈緩沖液(10×),配方如下:
400mmol/L Tris·Cl ,pH7.2; 850mmol/L KCl; 44mmol/L MgCl2;
30mmol/L DTT; 0.5mg/ml BSA。
500μ RNase H
500μ DNA聚合酶Ⅰ
100μ T4 DNA聚合酶Ⅰ
2×1.25ml 不含核酸酶的水
以上所有試劑除對照RNA需在-70℃保存外,其余均可保存于-20℃,可以合成40μg mRNA。
(一) 第一鏈合成
1. 試劑
[α-32 P] dCTP (>400Ci/mmol),EDTA (50mM和200mM),TE-飽和酚:氯仿(1:1),7.5M NH4Ac,乙醇(100%和70%),TE緩沖液。
2. 操作步驟
(1) 取一滅菌的無RNA酶的eppendorf管,加入RNA模板和適當引物,每μg RNA使用0.5μg引物(如使用NotⅠ引物接頭,使用0.3μg),用H2 O調整體積至15μl, 70℃處理5分鐘,冷卻至室溫,離心使溶液集中在管底,再依次加入。
5×第一鏈緩沖液 5μl
rRNasin RNA酶抑制劑 25U
M-MLV(H- )反轉錄酶 200U
H2O調至總體積25μl
(2) 用手指輕彈管壁,吸取5μl至另一eppendorf管,加入2-5μCi [α-32 P] dCTP (>400Ci/mmol),用以第一鏈同位素摻入放射性活性測定。
(3) 37℃(隨機引物)或42℃(其它引物)溫浴1小時
(4) 取出置于冰上
(5) 摻入測定的eppendorf管加入95μl 50mM EDTA終止反應,并使總體積為100μl。可取90μl進行電泳分析(先用苯酚抽提),另10μl進行同位素摻入放射性活性測定。
(6) 第一鏈合成eppendorf管可直接用于第二鏈合成
注:以上25μl反應總體積中所用RNA量為1μg,如合成5μg RNA,則可按比例擴大反應體積, 倒5μg RNA使用125μl總體積進行合成。