生物學入門:關于TRIzol 提取總RNA的介紹
TRIzol是廣譜型中RNA提取試劑。廣泛應用于植物材料、動物組織、細胞及各種微生物等樣品中提取RNA.本試劑能夠提取完整的RNA。加入氯仿離心后,溶液分為三層:上層無色水相、中間層和下層紅色有機相,RNA分布在上層水相中,收集上清層后,經異丙醇沉淀便可以回收得到總 RNA。提取的總 RNA 完整性好,無蛋白和 DNA 污染,可用于各種分子生物學常規實驗,如 RT-PCR、Real-timeRT-PCR、NorthernBlot、DotBlot、體外翻譯等。
實驗試劑:
TRIzol(德元國際Cat# LY6151)、無水乙醇、氯仿、異丙醇、75%酒精、液氮
實驗用具:
高速離心機、研缽、移液器,離心管,一次性手套、口罩等
操作步驟:
1. 樣品處理
1) 動物組織:取新鮮或-70℃凍存動物組織盡量剪碎,每30-50mg 組織加入1mlTRIzol(德元國際Cat# LY6151),勻漿儀進行勻漿處理?;蛟谝旱醒心ズ蠹尤隩RIzol1ml(德元國際Cat# LY6151)混勻。
2) 植物組織:取新鮮植物組織在液氮中充分研磨或將植物組織剪碎后直接在TRIzol(德元國際Cat# LY6151)中迅速研磨,每30-50mg 組織加入1mlTRIzol,混勻。
3) 單層培養細胞:吸去培養液,加入適量TRIzol(每10cm2面積1mlTRIzol),反復吹打使細胞裂解。如果TRIzol的量不足可能導致RNA中有DNA污染。
4) 細胞懸液:不洗滌細胞,直接離心收集細胞。每5×106-1×107動物、植物和酵母細胞或每107細菌細胞加入1mlTRIzol(德元國際Cat# LY6151)。
可選步驟:當樣品富含蛋白質,脂肪,多糖或是細胞外物質例如肌肉,脂肪組織和植物的塊莖部分時可能需要一額外的分離步驟。勻漿化后在2~8°C的條件下以12,000×g的離心力離心10分鐘,移除勻漿中不溶解的物質,余下的沉淀中包含有細胞外膜,多糖,以及高分子量DNA,而RNA存在于上清中。對于脂肪組織的樣品中,大量的脂肪漂在最上層也應該除掉。吸取上清備用。
2. 將勻漿樣品反復吹打幾次,在室溫條件下靜置5min,使蛋白核酸復合物完全分離。
3. 向以上溶液中加入氯仿,每使用1mlTRIzon加入0.2ml氯仿,蓋好管蓋,劇烈振蕩15秒,室溫放置2-3min。
4. 4℃ 12,000 rpm離心15分鐘,此時樣品分成三層:紅色有機相,中間層和上層無色水相,RNA 主要在水相中,把水相(約600μl)轉移到一個新的離心管(自備)中。
5. 在得到的水相溶液中加入等體積異丙醇,顛倒混勻,室溫放置10分鐘。
6. 4℃ 12,000rpm 離心10分鐘,棄上清。
7. 加入75%乙醇(用無RNase的水配制)洗滌沉淀。每使用1mlTRIzol用1ml75%乙醇對沉淀進行洗滌一次。
8. 4℃ 12,000rpm離心3分鐘,小心吸棄上清,注意不要吸棄RNA沉淀。
9. 室溫放置3-5分鐘,晾干。加入30-100μl無RNase的水,充分溶解RNA,得到的RNA保存在-70℃,防止降解。
注意:沉淀不要過分干燥,以免難于溶解。