cDNA文庫組標準流程
第一部分 Total RNA 的提取
一、 試劑配制
準備工作:
1、研缽、5ml/10ml/ 25ml移液管、100ml/250ml量筒、250ml/100ml容量瓶、藥匙、 試劑瓶等玻璃制品均用錫紙包裹口部,置于烤箱內(nèi),180℃,烤6小時。
2、50ml/1.5ml離心管、槍頭等塑料制品用0.1‰DEPC水浸泡過夜后,121℃ 20mins 高壓滅菌。
3、電泳槽及電泳托、梳子用3%雙氧水處理。
4、常用試劑及其配方:
▲DEPC水:在1000ml去離子水中加入100ul DEPC, 靜置過夜后高壓滅菌。
▲0.78M檸檬酸納:PH=4~5
三水合檸檬酸納 22.94g
加DEPC水定容至100ml,室溫放置備用。
▲10%肌氨酸鈉:
肌氨酸鈉 10g
加DEPC水定容至100ml,室溫放置備用。
▲變性裂解液:
0.78M檸檬酸鈉 8.25ml
10%肌氨酸鈉 12.375ml
異硫氰酸胍 118.05g
加DEPC水定容至 250ml,室溫放置備用
臨用前加β-巰基乙醇使其終濃度為1%(v/v)
▲2M 醋酸鈉 PH=4.5
NaAc?3H2O 13.6g
加DEPC水定容至50ml,高壓滅菌,室溫放置備用
▲3M醋酸鈉PH=5
NaAc?3H2 O 20.4g
加DEPC水定容至50ml,高壓滅菌,室溫放置備用
▲ 4M LiCL:
LiCL 24.164g
加DEPC水定容至100ml,高壓滅菌,室溫放置備用
▲0.5M EDTA PH=8.0
EDTA 18.61g
用NaOH調(diào)PH值至8.0,定容到100ml,高壓滅菌,室溫放置備用
▲10X MOPS (3-(N-嗎啉代)丙磺酸):
MOPS 41.86g
NaAC?3H2O 4.10g
0.5MEDTA(PH 8.0) 20ml
用NaOH調(diào)PH值 6.5 , DEPC水定容到1L,室溫避光放置備用。
▲1x MOPS:
10x MOPS 30ml
加DEPC水270ml,用時現(xiàn)配。
▲4x RNA Loading buffer:
10x MOPS 400ul
甘油(高壓過) 200UL
溴酚蘭 10ul
甲醛(37%) 72ul
去離子甲酰氨 310ul
EDTA(0.5M PH 8.0) 8ul
ErBr(10mg/ml in DEPCH2O) 70ul
在4℃ 可保持3個月
▲10x PBS
pH=7.4
NaCl 80g
KCl 2g
Na2HPO4 14.4g
KH2PO4 2.4g
定容至1000ml
▲變性電泳膠:
稱取0.5g瓊脂糖,加入47.5ml 1x MOPs,加熱至瓊脂糖熔化后,冷卻至50℃左右,加入2.5ml甲醛,輕輕混勻后倒入電泳托上。
▲變性電泳緩沖液:
在250ml容量瓶內(nèi)加入5ml甲醛,用1x MOPS定容至250ml。