組織和細胞RNA的制備:異硫氰酸胍法
(一)試劑準備
1. CSB緩沖液:42mM檸檬酸鈉;0.83% N-lauryl sarcosine(十二烷基,N甲基甘氨酸鈉);0.2 mM β-巰基乙醇。
2. 變性液:異硫氰酸胍(終濃度 4 M)25g、CSB緩沖液 33ml,混合直至完全溶解,可在65℃助溶。4℃保存備用。
3. 2 M乙酸鈉:pH 4.0。
4. 異丙醇
5. 無水乙醇、70%乙醇
6. 酚:氯仿:異戊醇(25:24:1)
7. DEPC H2O:100ml ddH2O中,加入DEPC 0.1ml,棄分振蕩,37℃孵育過夜。15磅高壓滅茵,4℃保存備用。
(二)操作步驟
1. 樣品處理:
(1)培養細胞:收集細胞1-2×107,離心,500g×5min。對于貼壁培養細胞,用0.25%胰蛋白酶-EDTA消化后,PBS重懸細胞并轉移至10ml離心管中;懸浮培養細胞可直接轉移離心管;離心:500g×5min;PBS洗滌2次。棄上清,置冰浴。加預冷變性液2 ml,充分搖動,使細胞裂解完全。以下操作均在冰浴中進行。
(2)組織:取1-2g組織(新鮮或-70℃及液氮中保存的組織均可)置組織勻漿器中,加入預冷的變性液12ml,在冰浴中充分勻漿。
2. 加2 M乙酸鈉(pH 4.0)0.2ml,混合后將溶液轉移至5ml離心管中。
3. 加酚:氯仿:異戊醇2.2ml,顛倒混合用力振蕩10s,冰上放置10min。
4. 4℃離心,12000g×20min。
5. 小心吸取上層含有RNA的水相,并轉移至一新的5ml離心管中。避免吸取兩相之間的蛋白物質。
6. 加等體積的異丙醇,置-20℃至少30min,沉淀RNA。
7. 4℃離心,12000g×15min。
8. 棄上清,再加變性液2ml重懸RNA沉淀物,振蕩直至RNA完全溶解(必要時可65℃水浴促溶)。
9. 加入等體積異丙醇,置-20℃ 30min。
10. 4℃離心,12000g×15min。
11. 棄上清,加入70%乙醇4ml洗滌RNA沉淀。4℃離心,8000g×5min。
12. 棄上清,將沉淀晾干。
13. 加入適量DEPC H2O溶液解RNA(65℃促溶10-15min)。
(三)注意事項:
1. 所有實驗過程均須避免Rnase的污染。
2. 要避免沉淀完全干燥,否則RNA難以溶解。