環(huán)狀 RNA 測序案例分析
案例:以結(jié)腸癌,卵巢癌,特發(fā)性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關(guān)性
背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是構(gòu)成生物體 RNA 網(wǎng)絡(luò)的一部分,而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學(xué)功能。
目的:利用 Illumina 測序平臺對細(xì)胞增殖速度不同的樣品(正常組織和細(xì)胞,不同腫瘤組織和細(xì)胞,非腫瘤疾病組織和細(xì)胞)的 circular RNAs 進(jìn)行分析,探究 circular RNAs 的富集與細(xì)胞增殖的相關(guān)性。
結(jié)果:首次發(fā)現(xiàn) circular RNAs 在組織和細(xì)胞的富集程度與細(xì)胞增殖速度呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)關(guān)系,即腫瘤組織和細(xì)胞中 circular RNAs 表達(dá)量顯著低于正常組織和細(xì)胞。
原文索引:
Bachmayr-Heyda, A. et al. (2015). Correlation of circular RNA abundance with proliferation--exemplified with colorectal and ovarian cancer, idiopathic lung fibrosis, and normal human tissues. Sci Rep 5, 8057.