關于RNA提取的幾個問題
RNA快速提取程序
組織RNA的提?。?將約10~100 mg的組織塊置于勻漿儀中,加入1 ml RNA快速提取 試劑 ,進行勻漿;將勻漿液傾入1.5 ml 離心管 中,加入0.1體積的氯仿,振蕩混合20 s;冰上放置5 min;4℃離心12 000 r. min-1 , 15 min。 離心管 中的液體分為3層: 上層為無色透明的無機相,RNA保留于此相中;下層為呈淡黃色的有機相,蛋白質保留于此相中;上下兩層的界面處為中間層,DNA 保留于此相中。小心吸取上層水相約0.5 ml于新管中,切勿吸取中間層和下層液體,以避免DNA 和蛋白質的污染。異丙醇沉淀:加入等體積的-20℃預冷的異丙醇,混勻,4℃離心12 000 r. min-1 ,15 min, 棄上清;用0.5 ml預冷的80%(體積分數)乙醇洗滌沉淀,棄盡乙醇,在空氣中自然干燥,溶于適量DEPC處理的水中,用于后續的實驗或-80℃保存。
RNA的質量、純度鑒定和濃度測定
取1~2 μl RNA樣品在15 g. L-1 瓊脂糖凝膠上進行電泳 ,檢查RNA的質量,主要觀察28 S、18 S和5 S三條帶是否清晰,有無降解,以及是否有DNA 污染。
取1~2 μl RNA樣品溶于1 ml超純水中,用紫外分光光度法測定D值。以D260 值計算其濃度,計算公式:
質量濃度(g. L-1 )=40×D260 ×稀釋倍數/1000
以D260 /D280 的比值表示其純度,比值在1.8~2.0之間為純的RNA,比值低于1.8,說明RNA樣品有蛋白質或酚的污染,需要用氯仿重新抽提。
勻漿方式對RNA質量的影響
在實驗中我們發現不同的勻漿方式對RNA的質量有明顯的影響。通過反復實驗發現,用超聲勻漿儀勻漿易引起RNA的降解,且RNA的回收率很低;用手動玻璃勻漿器進行組織勻漿,獲得的RNA無降解,回收率高,而且操作簡單,是一種較理想的組織勻漿方式。