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衛(wèi)星DNA
發(fā)布日期:2022-12-09 08:45:35


衛(wèi)星DNA


衛(wèi)星DNA(satellite DNA)是一類高度重復(fù)序列 DNA在介質(zhì)氯化銫中作密度梯度離心,離心速度可以高達(dá)每分鐘幾萬轉(zhuǎn);此時(shí)DNA分子將按其大小分布在離心管內(nèi)不同密度的氯化銫介質(zhì)中,小的分子處于上層,大的分子處于下層;從離心管外看,不同層面的DNA形成了不同的條帶。根據(jù)熒光強(qiáng)度的分析,可以看到在一條主帶以外還有一個(gè)或多個(gè)小的衛(wèi)星帶。這些在衛(wèi)星帶中的DNA即被稱為衛(wèi)星DNA,這種DNA的GC含量一般少于主帶中的DNA,浮力密度也低。
衛(wèi)星DNA按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四類,其浮力密度分別是1.687,1.693,1.697和1.700 g/cm3。各類衛(wèi)星DNA都是由各種不同的重復(fù)序列家族所組成。衛(wèi)星DNA通常是串聯(lián)重復(fù)序列。衛(wèi)星DNA按其重復(fù)單元的
核苷酸的多少,可以分為兩類。一類是小衛(wèi)星DNA(minisatellite DNA),由幾百個(gè)核苷酸對(duì)的單元重復(fù)組成。另一類是微衛(wèi)星DNA(microsatellite DNA),由2個(gè)到20個(gè)左右的核苷酸對(duì)的單元重復(fù)成百上千次所組成。衛(wèi)星DNAI家族由42bp的單元組成,其中17bp(ACATAAAATAT AAAGT)為可變區(qū),25 bp(ACCCAAAAAGT TATTATATACTGT)為重復(fù)單元。衛(wèi)星DNAⅡ家族是保守性差的ATTCC重復(fù)。衛(wèi)星DNAⅢ是較保守的ATTCC重復(fù),且與10bp的序列(A TCGGGTTG)相間分布。衛(wèi)星DNA還有另一些分類的名稱,如α衛(wèi)星DNA是靈長類特有的單元為171 bp的高度重復(fù)序列,最初是在非洲青猴基因組中發(fā)現(xiàn),現(xiàn)在已確定分布在人染色體的著絲粒區(qū)。β衛(wèi)星DNA家族是單元為68bp的串聯(lián)重復(fù)序列,富含GC。γ衛(wèi)星DNA是220 bp的串聯(lián)重復(fù)。第Ⅳ類衛(wèi)星DNA稱為隱藏的衛(wèi)星DNA(cryptil satellite)。這是包含了多種串聯(lián)重復(fù)序列的DNA分子,離心時(shí)并不像衛(wèi)星DNA那樣也分開,但它的屬性卻類似衛(wèi)星DNA。


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