正確使用DEPC
DEPC有致癌性,不能處理Tris溶液等這些事項大家都知道,所以不談。談一些實驗室中的操作誤區。
誤區一:重復使用含DEPC的水處理槍頭、離心管等。由于DEPC較貴,而且書上說DEPC要用高壓滅菌處理去除,于是有些人就萌發了重復使用DEPC的想法,即對含有DEPC的水不進行高壓滅菌,從而重復使用含DEPC的水處理槍頭、離心管等。節約本是好事,但這樣的節約是無效的。為什么不能重復使用含DEPC的水,因為DEPC在水溶液中不穩定,極易分解,DEPC在pH6.0和pH7.0的PBS緩沖液中的半衰期分別約為20min和10min,DEPC在水中的半衰期約為30min。因此,重復使用含DEPC的水就不能保證槍頭和離心管的RNase-free。
誤區二:必需長時間高壓滅菌來徹底去除DEPC。用DEPC處理過的溶液,在15-20min的高壓滅菌后還可以聞到一股特殊的香味,因此有人認為高壓滅菌去除DEPC不徹底,所以要延長高壓滅菌的時間以完全去除DEPC。但是延長高壓滅菌的時間并不需要,因為聞到的特殊香味不是DEPC的,而是DEPC分解產物之一的乙醇同溶液中殘留的微量的羧酸(如甲酸和乙酸等)反應產生的揮發性脂類。這種特殊的水果香味不代表有痕量的DEPC殘留。
誤區三:溶液中DEPC含量約高,滅活RNase的效果越好。這個誤區錯了一半,的確,1% DEPC能滅活高達1000 ng/ml的RNase A,而0.1% DEPC只能滅活少于500 ng/ml的RNase A。但是溶液中殘留的DEPC副產物會抑制一些酶反應,例如DEPC副產物會抑制體外轉錄反應,因此DEPC含量越高,高壓滅菌后的DEPC副產物就越多,抑制越明顯。