siRNA對照

1, 普通陰性對照

siRNA實驗應該有陰性對照；
通用陰性對照為與目的基因的序列無同源性的普通陰性對照；
Scrambled陰性對照和選中的siRNA序列有相同的組成，但是和mRNA沒有明顯的同源性；
陰性對照需要確定和目的靶細胞中其它基因同源性很低。
 

2, 熒光標記陰性對照

RNAi negative control與哺乳動物基因無同源性；
通過標記熒光，可以方便地在熒光顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)染情況；
可用于優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件和評價轉(zhuǎn)染效率；
具備很好的pH耐受性，在活細胞中更穩(wěn)定。
 

3, siRNA陽性對照

陽性對照作為一個實驗系統(tǒng)檢查是很重要的。
可以利用陽性對照來確認RNAi實驗中轉(zhuǎn)染、RNA提取和基因表達檢測方法是可靠的。
siRNA陽性對照較為常用的如下：
LaminA/C，GFP22，Luciferase GL2， MAPK1， Beta-Actin，Vimentin， P53， GAPDH， Cyclophilin B

4, -轉(zhuǎn)染試劑對照

對于一個完善的對照系統(tǒng)，轉(zhuǎn)染試劑對照(Mock transfection )是不可缺的。
轉(zhuǎn)染試劑對照可以檢測轉(zhuǎn)染試劑對細胞的毒性、細胞的成活率等細胞轉(zhuǎn)染的各個因素影響。

5, 避免Off-target對照

對于RNAi研究來說，在哺乳動物中，off-target效應是一個十分關注的問題。
有大量的報道，一個siRNA影響多個基因的表達。
因此，大量研究關注于用針對同一個基因的不同區(qū)域的多個siRNA進行實驗，
然后分析各自對基因表達效果的影響。理想的結果是針對不同區(qū)域的siRNA對同一個靶基因產(chǎn)生相似的干擾效果。