全基因組重測序

全基因組關聯分析（Genome-Wide Association Study，GWAS）在動植物的研究中對于重要性狀特別是復雜形狀的定位有著快速、準確的優點。基于高通量測序對某種農作物或禽畜的代表性品種、地方種或野生種進行基因分型，結合準確的表型數據可對農作物或禽畜重要復雜性性狀進行定位。特別是在包含了野生種、馴化種和改良種的群體中，結合群體進化分析對收到馴化和改良的重要基因進行定位，是研究作物或禽畜微進化及馴化改良表型的重要思路。

應用領域
全基因組范圍內多性狀的定位；目標性狀的生物學基礎研究。

產品優勢
1、高通量檢測全基因組SNP并進行關聯分析，掃除定位盲點；
2、重重篩選SNP，多重檢驗顯著性，保證結果準確性；
3、同時對多種性狀進行定位；
4、定位精度至多可達單基因水平。

標準信息分析
1、已有參考基因組序列的動植物自然群體；
2、樣本間無明顯的亞群分化（如生殖隔離等）；
3、所研究表型性狀遺傳力較強。
4、≥200個樣本；
5、基于SNP：≥5 X/個體；
6、基于CNV：≥30X/個體 10~20W Tags；
7、平均8 X/Tag；
8、測序數據質量評估；
9、與參考基因組比對；
10、CNV檢測及注釋 SNP檢測及注釋；

高級信息分析
1、構建系統進化樹；
2、群體主成分分析；
3、連鎖不平衡分析；
4、性狀關聯分析；
5、目標性狀相關區域基因功能注釋；
6、構建單體型圖譜。

樣品要求
1、樣品類型：基因組DNA；
2、樣品需求量：單次2 ug；
3、樣品濃度：文庫≥30 ng/μl；
4、樣品純度：OD260/280為1.8-2.0；
5、電泳要求：主帶清晰，無降解或輕度降解。（距送樣日最近的電泳結果）