高度重復序列

高度重復序列在基因組中重復頻率高，可達百萬(106)以上，因此復性速度很快。在基因組中所占比例隨種屬而異，約占10-60％，在人基因組中約占20％。高度重復順序又按其結構特點分為三種。

（1）倒位（反向）重復序列

　　這種重復順序復性速度極快，即使在極稀的DNA濃度下，也能很快復性，因此又稱零時復性部分，約占人基因組的5％。反向重復序列由兩個相同順序的互補拷貝在同一DNA鏈上反向排列而成。變性后再復性時，同一條鏈內的互補的拷貝可以形成鏈內堿基配對，形成發夾式或“ ”字形結構。倒位重復（即兩個互補拷貝）間可有一到幾個核苷酸的間隔，也可以沒有間隔。沒有間隔的又稱回文（palimdr－ome），這種結構約占所有倒位重復的三分之一。若以兩個互補拷貝組成的倒位重復為一個單位，則倒位重復的單位約長300bp或略少。兩個單位之間有一平均1.6kb的片段相隔，兩對倒位重復單位之間的平均距離約12kb，亦即它們多數散布非群集于基因組中。

（2）衛星DNA

　　衛星DNA(satelliteDNA)是另一類高度重復序列，這類重復順序的重復單位一般由2-10bp組成，成串排列。由于這類序列的堿基組成不同于其他部份，可用等密度梯度離心法將其與主體DNA分開，因而稱為衛星DNA或隨體DNA。在人細胞組中衛星DNA約占5-6％。按照它們的浮力密度不同，人的衛星DNA可分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四種。果蠅的衛星DNA順序已經搞清楚，可分為三類，這三類衛星DNA都是由7bp組成的高度重復順序：衛星Ⅰ為5'ACAACT3',衛星Ⅱ為5'ACAAATT3'。而蟹的衛星DNA為只有AT兩個堿基的重復順序組成。

（3）較復雜的重復單位組成的重復順序

　　這種重復順序為靈長類所獨有。用限制性內切酶HindⅢ消化非洲綠猴DNA，可以得到重復單位為172bp的高度重復順序，這種順序大部份由交替變化的嘌呤和嘧啶組成。有人把這類稱為α衛星DNA。而人的α衛星DNA更為復雜，含有多順序家族。

（4）高度重復順序的功能
　　a.參與復制水平的調節反向序列常存在于DNA復制起點區的附近。另外，許多反向重復序列是一些蛋白質（包括酶）和DNA的結合位點。
　　b.參與基因表達的調控DNA的重復順序可以轉錄到核內不均一RNA分子中，而有些反向重復順序可以形成發夾結構，這對穩定RNA分子，免遭分解有重要作用.
　　c.參與轉位作用幾乎所有轉位因子的末端都包括反向重復順序，長度由幾個bp到1400bp。由于這種順序可以形成回文結構，因此在轉位作用中即能連接非同源的基因，又可以被參與轉位的特異酶所識別。
　　d.與進化有關不同種屬的高度重復順序的核苷酸序列不同，具有種屬特異性，但相近種屬又有相似性。如人的α衛星DNA長度僅差1個堿基（前者為171bp，后者為172bp），而且堿基序列有65％是相同的，這表明它們來自共同的祖先。在進化中某些特殊區段保守的，而其他區域的堿基序列則累積著變化。
　　e.同一種屬中不同個體的高度重復順序的重復次數不一樣，這可以作為每一個體的特征，即DNA指紋。
　　f.α衛星DNA成簇的分布在染色體著絲粒附近，可能與染色體減數分裂時染色體配對有關，即同源染色體之間的聯會可能依賴于具有染色體專一性的特定衛星DNA順序。

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