原位雜交實驗要求及步驟
原位雜交組織(或細胞)化學 (In situ Hybridization Histochemistry,ISHH) 簡稱原位雜交(In Situ Hybridization),屬于固相分子雜交的范疇,它是用標記的DNA或RNA為探針,在原位檢測組織細胞內特定核酸序列的方法。
根據所用探針和靶 核酸的不同,原位雜交可分為DNA-DNA雜交,DNA-RNA雜交和RNA-RNA雜交三類。根據探針的標記物是否直接被檢測,原位雜交又可分為直接法 和間接法兩類。
直接法主要用放射性同位素、熒光及某些酶標記的探針與靶核酸進行雜交,雜交后分別通過放射自顯影、熒光顯微鏡術或成色酶促反應直接顯示。間 接法一般用半抗原標記探針,最后通過免疫組織化學法對半抗原定位,間接地顯示探針與靶核酸形成的雜交體。
原位雜交最初是以同位素標記探針進行的。盡管同位 素標記(如35S,3H,32P等)仍然廣泛使用,但非同位素標記探針的迅速發展(尤其是生物素標記探針和地高辛標記探針),更引起科技工作者的極大興趣。
一、基本要求
組織取材:組織取材應盡可能新鮮。由于組織RNA降解較快,所以新鮮組織和培養細胞最好在30min內固定。
固定目的是:
(1)保持細胞結構;
(2)最大限度地保持細胞內DNA或RNA的水平;
(3)使探針易于進入細胞或組織。
最常用的固定劑是多聚甲醛,與其它醛類固定劑(如戊二醛)不同,多聚甲醛不會與蛋白質產生廣泛的交叉連接,因而不會影響探針穿透入細胞或組織。
增強組織的通透性和核酸探針的穿透性:
(1) 稀酸處理和酸酐處理:為防止探針與組織中堿性蛋白之間的靜電結合,以降低背景,雜交前標本可用0.25%乙酸酐處理10min,經乙酸酐處理 后,組織蛋白中的堿性基團通過乙酰化而被阻斷。組織和細胞標本亦可用0.2M HCl處理10min,稀酸能使堿性蛋白變性,結合蛋白酶消化,容易將堿性蛋白移除。
(2) 去污劑處理:去污劑處理的目的是增加組織的通透性,利于雜交探針進入組織細胞,最常應用的去污劑是Triton X-100。注意:過度的去污劑處理不僅影響組織的形態結構,而且還會引起靶核酸的丟失。
(3) 蛋白酶處理:蛋白酶消化能使經固定后被遮蔽的靶核酸暴露,以增加探針對靶核酸的可及性。常用的蛋白酶有蛋白酶K(proteinase K),還有鏈霉蛋白酶(pronase)和胃蛋白酶(pepsin)等。
雜交緩沖液孵育:
雜交前用不含探針的雜交緩沖液在雜交溫度下孵育2hr,以阻斷玻片和標本中可能與探針產生非特異性結合的位點,達到減低背景的目的。
防止污染:
由于在手指皮膚及實驗室用玻璃器皿上均可能含有RNA酶,為防止其污染影響實驗結果,在整個雜交前處理過程中都需要戴消毒手套,實驗所用玻璃器皿及鑷子都應于實驗前一日置高溫烘烤(180℃)以達到消除RNA酶的目的。雜交前及雜交時所用的溶液均需經高壓消毒處理。
雙鏈DNA探針和靶DNA的變性:
雜交反應進行時,探針和靶核酸都必須是單鏈的。如果用雙鏈DNA探針進行雜交(包括檢測RNA時),雙鏈DNA探針在雜交前必須進行變性。探針變性后要立即進行雜交反應,不然解鏈的探針又會重新復性。
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